就業規則に反する労働契約は、無効ですか。

就業規則は、その職場で働く労働者の労働条件の最低基準を定めたものです。したがって、就業規則で定める基準に達しない労働条件を定める労働契約は、その部分については無効となります。無効となった部分は、就業規則で定める基準によることになります。
逆に、就業規則と異なっていても、就業規則の定める内容よりも労働契約の内容が労働者にとって有利なものであれば、無効となることはありません。